1915年 创建时期
北京世纪坛医院创建于1915年4月,初址位于北京康家胡同,名为“北京京汉铁路医院”。
1945年-1949年 新中国成立时期
1945年日本投降后,医院由国民党政府接管,更名为“平津区平津铁路管理局铁路总医院”。1948年,医院迁入佟麟阁路新址,床位增至200张左右。1949年,北平和平解放,医院由中国人民解放军交通指挥部接管。
1958年定名为“铁道部北京铁路总医院”
1950年定名“铁道部铁路总医院”。1958年6月,北京铁道医学院成立后,医院成为北京铁道医学院附属医院,1958年8月医院迁入现址,当时设计床位600张。北京铁道医学院撤消后,医院几经更改,最后定名为“铁道部北京铁路总医院”。
2005年更名为“北京世纪坛医院”
2004年6月11日医院移交北京市政府管理,为北京市卫生局直属三级甲等医院,2005年1月1日正式更名为“北京世纪坛医院”。
2011年更名为“首都医科大学附属北京世纪坛医院”
2011年1月1日起,正式更名为“首都医科大学附属北京世纪坛医院”。